Comienza con los documentos del siglo XIV de judíos residentes en lo que en la actualidad es Estonia.
Esto permitió a los denominados ‘Soldados de Nicolás’ y sus descendientes, cantonistas, mercaderes, artesanos y judíos con alto nivel educativo a residir en Estonia y en otras partes del Imperio.
La congregación de Tallin, la mayor de Estonia, se fundó en 1830 cuando llegaron las cincuenta primeras familias. Se construyeron varias Sinagogas, de las cuales, la mayor fue construida en la capital en 1883 y otra de gran tamaño fue construida

